RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AHI1Q8N157 1196 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOXJ1Q92949 421 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC39A13Q96H72 371 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NOX5Q96PH1 765 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LHX5Q9H2C1 402 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACP6Q9NPH0 428 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITM2CQ9NQX7 267 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GGA2Q9UJY4 613 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PILRBQ9UKJ0 227 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THADAQ6YHU6 1953 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C4orf47A7E2U8 309 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBL1XO60907 577 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EPHX1P07099 455 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADRB1P08588 477 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITPKAP23677 461 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT9P35527 623 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYPL2Q5VXT5 272 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHST9Q7L1S5 443 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADIPOR2Q86V24 386 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FIBINQ8TAL6 211 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIPA1Q96FS4 1042 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIX2Q9NPC8 291 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM74BQ9NUR3 256 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPTBN2O15020 2390 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PATE3B3GLJ2 98 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APOEP02649 317 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC2A3P11169 496 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD6P30203 668 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OXTRP30559 389 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC6A4P31645 630 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APBA1Q02410 837 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TAC4Q86UU9 113 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDTC1Q8N5D0 677 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BTN2A3PQ96KV6 586 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM245Q9H330 911 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBRSQ9HAH7 460 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LMBRD1Q9NUN5 540 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP83Q9Y592 693 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLV3-19P01714 112 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERPINF2P08697 491 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACADMP11310 421 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRKCHP24723 683 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SGSHP51688 502 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDK17Q00537 523 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTA1Q13330 715 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MIIPQ5JXC2 388 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MBLAC2Q68D91 279 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MFN1Q8IWA4 741 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DEFB119Q8N690 84 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CADM4Q8NFZ8 388 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2T3Q8NH03 318 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAM32Q8TC27 787 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSPA12BQ96MM6 686 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CPXM1Q96SM3 734 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms