RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPSB4Q96A44 273 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TAAR9Q96RI9 348 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FZD10Q9ULW2 581 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A0A1B0GVT2 93 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BUB3O43684 328 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PIAS2O75928 621 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBXN7O94888 489 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLKB1P03952 638 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM225BP0DP42 221 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NOVP48745 357 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ITGA8P53708 1063 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FMO1Q01740 532 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRAF2Q12933 501 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PGM5Q15124 567 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 Q5PR19 223 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LCE3AQ5TA76 89 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LIPMQ5VYY2 423 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PMS2CLQ68D20 193 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP49Q70CQ1 688 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DPH1Q9BZG8 443 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.96□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SNED1Q8TER0 1413 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A0A1W2PPL8 197 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RGS14O43566 566 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NPR1P16066 1061 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CIITAP33076 1130 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXD12P35452 270 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRT2P35908 639 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPS2Q13227 327 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLCA4Q14CN2 919 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TPH2Q8IWU9 490 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZIM2Q9NZV7 527 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGSF9Q9P2J2 1179 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STAP2Q9UGK3 403 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.95□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BECN2A8MW95 431 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 H7C4K7 107 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BMPR1BO00238 502 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MARCH6O60337 910 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TUSC2O75896 110 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 F7P08709 466 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AKR1A1P14550 325 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AZU1P20160 251 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXC13P31276 330 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RASSF2P50749 326 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STK3Q13188 491 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KIF19Q2TAC6 998 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLMNQ96JQ2 1002 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LRGUKQ96M69 825 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EMSYQ7Z589 1322 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM227AF5H4B4 570 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RHODO00212 210 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRYO14603 147 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DUSP1P28562 367 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ABATP80404 500 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARHGEF7Q14155 803 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ODR4Q5SWX8 454 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GJA10Q969M2 543 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RUNDC1Q96C34 613 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms