RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 CIPCQ9C0C6 399 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 M0QYT0 321 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 GFRA2O00451 464 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 F9P00740 461 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FERP16591 822 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 STARD3Q14849 445 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 IQCB1Q15051 598 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 LPAL2Q16609 132 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM92Q6UXU6 159 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CBX8Q9HC52 389 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 STIM2Q9P246 746 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 TEX33O43247 280 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ADAM23O75077 832 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 IGLV3-25P01717 112 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.092e-6■■□□□ 14.3
SH3BP2-210ENST00000505941 WASP42768 502 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 NOMO3P69849 1222 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 GEN1Q17RS7 908 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CHSY1Q86X52 802 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO6Q9UM54 1294 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ANTXRLA6NF34 631 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 F5H5T6 163 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXC13P31276 330 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC6A4P31645 630 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CDH18Q13634 790 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ELF2Q15723 593 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RASSF3Q86WH2 238 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 XYLT1Q86Y38 959 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MFN1Q8IWA4 741 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 LGI2Q8N0V4 545 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 AHI1Q8N157 1196 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 HMGB4Q8WW32 186 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SPACA7Q96KW9 195 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GTH6 734 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1W2PQC6 194 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 H0Y626 953 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RHOBTB1O94844 696 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RETP07949 1114 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 TACR2P21452 398 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SULT1E1P49888 294 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FMO1Q01740 532 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 NADSYN1Q6IA69 706 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 LUZP1Q86V48 1076 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 TPSD1Q9BZJ3 242 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 WDCPQ9H6R7 721 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCB8Q9NUT2 735 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 GGA2Q9UJY4 613 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM170AA1A519 330 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP3K13O43283 966 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MOCS3O95396 460 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CHRNB2P17787 502 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MMP8P22894 467 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 DEUP1Q05D60 604 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CHST9Q7L1S5 443 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FIBINQ8TAL6 211 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 P2RY11Q96G91 374 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 LOXL4Q96JB6 756 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ACOX2Q99424 681 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 GABRG3Q99928 467 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 AGPAT1Q99943 283 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms