RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 AK5Q9Y6K8 562 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 FAM92AA1XBS5 289 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 GIPC1O14908 333 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SPOPO43791 374 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 RNF8O76064 485 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 EPCAMP16422 314 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PSMA2P25787 234 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SLC1A1P43005 524 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 TUBP50607 506 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 CDR1P51861 262 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 GRM2Q14416 872 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SDHAF4Q5VUM1 108 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 BTBD8Q5XKL5 378 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SCAMP5Q8TAC9 235 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 MYRFLQ96LU7 910 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SLC2A13Q96QE2 648 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 IGFLR1Q9H665 355 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 C12orf49Q9H741 205 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 FAM204AQ9H8W3 233 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 TJP2Q9UDY2 1190 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SLC6A14Q9UN76 642 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 GREB1Q4ZG55 1949 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 CLUHO75153 1309 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM191CA6NGB0 347 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 C2CD4BA6NLJ0 364 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 USP27XA6NNY8 438 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 YJEFN3A6XGL0 299 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 E7ENQ6 273 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PER2O15055 1255 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 BUB1O43683 1085 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PROSCO94903 275 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 MOCS3O95396 460 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SPATA31D3P0C874 917 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 NCAM1P13591 858 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PDGFRAP16234 1089 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PFKLP17858 780 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 GBP1P32455 592 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 ADH7P40394 386 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 MATKP42679 507 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PTPN9P43378 593 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SULT1E1P49888 294 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 TAF10Q12962 218 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 MTA1Q13330 715 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 DCAF6Q58WW2 860 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 DNAAF5Q86Y56 855 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 REXO1L1PQ8IX06 675 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 EFHBQ8N7U6 833 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 CLEC4CQ8WTT0 213 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 SERPINB11Q96P15 392 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 CNPY3Q9BT09 278 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 PIDD1Q9HB75 910 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 IL37Q9NZH6 218 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 GMIPQ9P107 970 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM10Q9UDY6 481 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM59LQ9UK28 342 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PQH9 124 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 GRID2IPA4D2P6 1211 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 J3QW42 95 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF197O14709 1029 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 CCL16O15467 120 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 GRAP2O75791 330 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 F9P00740 461 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 RDXP35241 583 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-211ENST00000497210 AIF1P55008 147 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms