RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SMARCE1-211ENST00000493660 H7C4K7 107 aa7.48□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 MATN2O00339 956 aa7.48□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 ADORA2BP29275 332 aa7.48□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 ESX1Q8N693 406 aa7.48□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 HES6Q96HZ4 224 aa7.48□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PBKQ96KB5 322 aa7.48□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 MED10Q9BTT4 135 aa7.48□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.48□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.47□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 SERPINB7O75635 380 aa7.47□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 ITGA9Q13797 1035 aa7.47□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 LIN52Q52LA3 116 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 BOLA3Q53S33 107 aa7.47□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.47□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SCML4Q8N228 414 aa7.47□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 36.3
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SMARCE1-211ENST00000493660 MYLPFQ96A32 169 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHL29Q96CT2 875 aa7.47□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 MPP4Q96JB8 637 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF558Q96NG5 402 aa7.47□□□□□ -1.21
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC9A7Q96T83 725 aa7.47□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 MYBPHLA2RUH7 354 aa7.47□□□□□ -1.21
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SMARCE1-211ENST00000493660 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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