RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 CDH7Q9ULB5 785 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 USTQ9Y2C2 406 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TPRP12270 2363 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 EPG5Q9HCE0 2579 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 MYO16Q9Y6X6 1858 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 E2F8A0AVK6 867 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CTAGE9A4FU28 777 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 KCNU1A8MYU2 1149 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CES2O00748 559 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SSR1P43307 286 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SLC11A2P49281 568 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CLCN5P51795 746 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 RWDD2BP57060 319 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 NTHL1P78549 312 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TUBB2AQ13885 445 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ODF2Q5BJF6 829 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 EFHC2Q5JST6 749 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SCYL2Q6P3W7 929 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 HTR3DQ70Z44 454 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 OTOP3Q7RTS5 596 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 MIB1Q86YT6 1006 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 KATNAL2Q8IYT4 538 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 RCOR2Q8IZ40 523 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SLC35F6Q8N357 371 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 EXD1Q8NHP7 514 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 OTUB2Q96DC9 234 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TCEAL4Q96EI5 215 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TUBB2BQ9BVA1 445 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 RNF38Q9H0F5 515 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 DONSONQ9NYP3 566 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D14Q9P2M4 693 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 FZD10Q9ULW2 581 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 EFR3BQ9Y2G0 817 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CACNA1GO43497 2377 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 PI15O43692 258 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 STC2O76061 302 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TBX18O95935 607 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CEBPBP17676 345 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TCP1P17987 556 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CASQ1P31415 396 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 HCAR3P49019 387 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 DPYSL2Q16555 572 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 FAM131BQ86XD5 332 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 NPAS3Q8IXF0 933 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ITFG1Q8TB96 612 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 FAM71BQ8TC56 605 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 FGF13Q92913 245 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SMARCD2Q92925 531 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 PBKQ96KB5 322 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 TKTL2Q9H0I9 626 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CARD9Q9H257 536 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 STOML2Q9UJZ1 356 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 NUDT5Q9UKK9 219 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CPQQ9Y646 472 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZNF292O60281 2723 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 DMXL1Q9Y485 3027 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 FTCDO95954 541 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 RARAP10276 462 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 L1CAMP32004 1257 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CHKAP35790 457 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 PEX5P50542 639 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ANGPT1Q15389 498 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 LRRC31Q6UY01 552 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 MTSS1LQ765P7 747 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 KCTD6Q8NC69 237 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ADAM32Q8TC27 787 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 NXPE3Q969Y0 559 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 ASB16Q96NS5 453 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 CYP2S1Q96SQ9 504 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 EPAS1Q99814 870 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-211ENST00000488243 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms