RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 RRN3Q9NYV6 651 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 COX16Q9P0S2 106 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 DMDP11532 3685 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PRR23AA6NEV1 266 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 M0QYT0 321 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 CCR1P32246 355 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 CRY1Q16526 586 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 GEN1Q17RS7 908 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MPP7Q5T2T1 576 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TRNP1Q6NT89 227 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TMEM92Q6UXU6 159 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 IFNKQ9P0W0 207 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TBL1XO60907 577 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A3P11169 496 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TACR2P21452 398 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 NME3Q13232 169 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 EOGTQ5NDL2 527 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ARCQ7LC44 396 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 RNF34Q969K3 372 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ACOX2Q99424 681 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TBCBQ99426 244 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 NUP58Q9BVL2 599 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PIGVQ9NUD9 493 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HRO43593 1189 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ABCB4P21439 1286 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HLA-FP30511 346 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SULT1E1P49888 294 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 RPS24P62847 133 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ASIC2Q16515 512 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 BNIPLQ7Z465 357 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TSTD1Q8NFU3 115 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 WFDC5Q8TCV5 224 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 EBF1Q9UH73 591 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQJ5 194 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 GFRA3O60609 400 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 APBB3O95704 486 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CALB1P05937 261 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 NTSR1P30989 418 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 PRKCIP41743 596 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CXCR3P49682 368 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 DGKEP52429 567 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TMEM215Q68D42 235 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 MON1BQ7L1V2 547 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CHSY1Q86X52 802 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 LGI2Q8N0V4 545 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 EMC1Q8N766 993 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.061e-24■■■□□ 16.3
ACTB-211ENST00000480301 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 EPC1Q9H2F5 836 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 STIM2Q9P246 746 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 GJB6O95452 261 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 F9P00740 461 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TNFAIP3P21580 790 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CNR2P34972 360 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 WASP42768 502 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 RASSF3Q86WH2 238 aa21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms