RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 SYN3O14994 580 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIAP1O43715 76 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF10O60809 474 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC14L2O76054 403 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 URODP06132 367 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 IRAK1P51617 712 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R50P59544 299 aa6.52□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.52□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 C16orf89Q6UX73 402 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.52□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 PDE7BQ9NP56 450 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 THAP1Q9NVV9 213 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 EHD2Q9NZN4 543 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PS29 197 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 ZAR1LA6NP61 321 aa6.51□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.51□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 Q8NA96 180 aa6.51□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.51□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 MPP6Q9NZW5 540 aa6.51□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 RARGP13631 454 aa6.5□□□□□ -1.37
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RABGGTB-209ENST00000473406 CDK18Q07002 472 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 CRYMQ14894 314 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM136AQ96C01 138 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL29Q96CT2 875 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 NPAS1Q99742 590 aa6.5□□□□□ -1.37
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