RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PNKP	Q96T60	521 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PRO3102	Q9H379	93 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	WHRN	Q9P202	907 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DCLK1	O15075	740 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	GRM6	O15303	877 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TTI1	O43156	1089 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DAPK3	O43293	454 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	MTSS1	O43312	755 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ATP8B1	O43520	1251 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PAGE1	O75459	146 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	GOT1	P17174	413 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ITIH2	P19823	946 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DNAJB1	P25685	340 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CA8	P35219	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SLC11A2	P49281	568 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PGF	P49763	221 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	VSNL1	P62760	191 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CAMK1	Q14012	370 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PDK1	Q15118	436 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PPP1R7	Q15435	360 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	C5orf22	Q49AR2	442 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC31	Q6UY01	552 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC45	Q96CN5	670 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	NACA2	Q9H009	215 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	IL21	Q9HBE4	155 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ASAH2	Q9NR71	780 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	HIDE1	A8MVS5	230 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	LRIG2	O94898	1065 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	RBP3	P10745	1247 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ERCC2	P18074	760 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	EPHB2	P29323	1055 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SLC7A9	P82251	487 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PBX4	Q9BYU1	374 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DRGX	A6NNA5	263 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF197	O14709	1029 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	COCH	O43405	550 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	CREB3	O43889	395 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ARHGEF15	O94989	841 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MYOG	P15173	224 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	RHOQ	P17081	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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