RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.88■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 MPP7Q5T2T1 576 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF677Q86XU0 584 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 C18orf8Q96DM3 657 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 GABRG3Q99928 467 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 CIPCQ9C0C6 399 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 DDIT4Q9NX09 232 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 ELOVL2Q9NXB9 296 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 COX16Q9P0S2 106 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 STIM2Q9P246 746 aa24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PQF6 199 aa24.87■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 DAB1O75553 588 aa24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 HLA-FP30511 346 aa24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 SPEM2Q0P670 501 aa24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 PLK5Q496M5 336 aa24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 RNF34Q969K3 372 aa24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 ERLEC1Q96DZ1 483 aa24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 BTN2A3PQ96KV6 586 aa24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.87■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 SYCE3A1L190 88 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 WASH3PC4AMC7 463 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 NPC1O15118 1278 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 TIMM44O43615 452 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 SLC2A3P11169 496 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 PTMSP20962 102 aa24.86■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 E2F5Q15329 346 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 ELF2Q15723 593 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 NAA35Q5VZE5 725 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.86■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 LOXL4Q96JB6 756 aa24.86■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 ABCB8Q9NUT2 735 aa24.86■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.85■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM215Q68D42 235 aa24.85■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 C11orf74Q86VG3 221 aa24.85■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 CHSY1Q86X52 802 aa24.85■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 SORCS1Q8WY21 1168 aa24.85■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.85■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 GGA2Q9UJY4 613 aa24.85■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.84■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 STARD3Q14849 445 aa24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 C2CD6Q53TS8 623 aa24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.84■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 CHST9Q7L1S5 443 aa24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 XYLT1Q86Y38 959 aa24.84■■□□□ 1.57
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SMKR1-201ENST00000462322 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 LGI2Q8N0V4 545 aa24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 RLN3Q8WXF3 142 aa24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 SPACA7Q96KW9 195 aa24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.83■■□□□ 1.57
SMKR1-201ENST00000462322 M0QYT0 321 aa24.83■■□□□ 1.57
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