RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 BTN2A3PQ96KV6 586 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 HS3ST4Q9Y661 456 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 C5orf42Q9H799 3197 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 CST8O60676 142 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 TJP3O95049 919 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 CKMP06732 381 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 ARL4AP40617 200 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 SLC7A9P82251 487 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 ITIH3Q06033 890 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 BBS12Q6ZW61 710 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 UNC45BQ8IWX7 931 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 PRELID2Q8N945 189 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 PLD4Q96BZ4 506 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 LRCH3Q96II8 777 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 APOL5Q9BWW9 433 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 CPQQ9Y646 472 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-209ENST00000460297 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 LRIG2O94898 1065 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 KLKB1P03952 638 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 IRF1P10914 325 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 PFKLP17858 780 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DYNLT1P63172 113 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 POTEHQ6S545 545 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 C1orf74Q96LT6 269 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 H3BRJ5 948 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ZNF197O14709 1029 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 AMPD1P23109 780 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.69e-7■■■■□ 25
NME4-209ENST00000460297 MS4A13Q5J8X5 152 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 MANEALQ5VSG8 457 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 RFX8Q6ZV50 586 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ITFG1Q8TB96 612 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 TASP1Q9H6P5 420 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CDH22Q9UJ99 828 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 NEU3Q9UQ49 428 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 EYSQ5T1H1 3165 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CEBPBP17676 345 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 HCAR3P49019 387 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 HARS2P49590 506 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DPYSQ14117 519 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 SLC9A4Q6AI14 798 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 NADSYN1Q6IA69 706 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 GPR149Q86SP6 731 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 C14orf80Q86SX3 495 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 PLD5Q8N7P1 536 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 MAIP1Q8WWC4 291 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 FAM161BQ96MY7 647 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 EPAS1Q99814 870 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ETNK2Q9NVF9 386 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CLEC1BQ9P126 229 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 XIRP2A4UGR9 3374 aa25.06■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DOCK4Q8N1I0 1966 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 SRGAP2BP0DMP2 458 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 TPI1P60174 286 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 TFDP2Q14188 446 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CTC1Q2NKJ3 1217 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DENND1CQ8IV53 801 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ZNF683Q8IZ20 524 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ING5Q8WYH8 240 aa25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 GREM1O60565 184 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 C1orf54Q8WWF1 131 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ATG4AQ8WYN0 398 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 HAUS1Q96CS2 278 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ZSWIM3Q96MP5 696 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 FAM118BQ9BPY3 351 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CLUHO75153 1309 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 SOBPA7XYQ1 873 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 E9PAM4 449 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CCDC188H7C350 402 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ACSL4O60488 711 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 TBX10O75333 385 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 IGFBP4P22692 258 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms