RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GEN1Q17RS7 908 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RASSF3Q86WH2 238 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RNF34Q969K3 372 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RRN3Q9NYV6 651 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HCN2Q9UL51 889 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.44■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NPC1O15118 1278 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TBL1XO60907 577 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC172P0C7W6 258 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCR1P32246 355 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MATKP42679 507 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FMO1Q01740 532 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ARID5AQ03989 594 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NADSYN1Q6IA69 706 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 XYLT1Q86Y38 959 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CBX8Q9HC52 389 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COX16Q9P0S2 106 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.43■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SERPINC1P01008 464 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CHRNB2P17787 502 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABCB4P21439 1286 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WASP42768 502 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SGSHP51688 502 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MTA1Q13330 715 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CHSY1Q86X52 802 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ACOX2Q99424 681 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GABRG3Q99928 467 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A1B0GTH6 734 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM170AA1A519 330 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TIMM44O43615 452 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HLA-FP30511 346 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NME3Q13232 169 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RNF43Q68DV7 783 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MFN1Q8IWA4 741 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PGBD3Q8N328 593 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HMGB4Q8WW32 186 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CIPCQ9C0C6 399 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 STIM2Q9P246 746 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GGA2Q9UJY4 613 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MYO6Q9UM54 1294 aa22.41■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A1W2PQC6 194 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 M0QYT0 321 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FERP16591 822 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TACR2P21452 398 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C2CD6Q53TS8 623 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LUZP1Q86V48 1076 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C11orf74Q86VG3 221 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LGI2Q8N0V4 545 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 AHI1Q8N157 1196 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DCLK2Q8N568 766 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMEM51Q9NW97 253 aa22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 F5H5T6 163 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RETP07949 1114 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MMP8P22894 467 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SULT1E1P49888 294 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CDH18Q13634 790 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 STARD3Q14849 445 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CHST9Q7L1S5 443 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KBTBD6Q86V97 674 aa22.39■■□□□ 1.17
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms