RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 AHI1Q8N157 1196 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 MINDY1Q8N5J2 469 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA1Q92805 767 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM245Q9H330 911 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 FRYQ5TBA9 3013 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 KCNJ18B7U540 433 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 OPHN1O60890 802 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 KRT37O76014 449 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 RGS7P49802 495 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 PAK1Q13153 545 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 SLC14A1Q13336 389 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 NNTQ13423 1086 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 PCED1AQ9H1Q7 454 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 FBRSQ9HAH7 460 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 FSCN3Q9NQT6 498 aa21.85■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN3O60637 253 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 EPHX1P07099 455 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 SLC11A2P49281 568 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 FOXC1Q12948 553 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 BEND5Q7L4P6 421 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 RRAGAQ7L523 313 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 ADIPOR2Q86V24 386 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T3Q8NH03 318 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 NUP58Q9BVL2 599 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 ABCB8Q9NUT2 735 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 GGA2Q9UJY4 613 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 GJB3O75712 270 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 ACADMP11310 421 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 GPD2P43304 727 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRNQ16849 979 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 CHST9Q7L1S5 443 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 STK32AQ8WU08 396 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINB11Q96P15 392 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 GPR174Q9BXC1 333 aa21.83■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 CACNA1EQ15878 2313 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GTW7 788 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 METTL12A8MUP2 240 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 MEI4A8MW99 385 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3R2O00459 728 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ACSL4O60488 711 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 FYNP06241 537 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 PROS1P07225 676 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 DLDP09622 509 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ACADSBP45954 432 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SGSHP51688 502 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TBX4P57082 545 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.82■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 CD59P13987 128 aa21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A4P31645 630 aa21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB16Q05516 673 aa21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A13Q96H72 371 aa21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.81■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 BIN1O00499 593 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 MED7O43513 233 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-EP13747 358 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 STX17P56962 302 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 GRIK2Q13002 908 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 MBLAC2Q68D91 279 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 FIBINQ8TAL6 211 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 WFDC5Q8TCV5 224 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 LMLNQ96KR4 655 aa21.8■■□□□ 1.08
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