RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 SPATA17Q96L03 361 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 NPY6RQ99463 290 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 IL37Q9NZH6 218 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 USP18Q9UMW8 372 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 LZTS1Q9Y250 596 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 NCAM1P13591 858 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 SULT1E1P49888 294 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 NCALDP61601 193 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 CCDC38Q502W7 563 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 LRRC34Q8IZ02 419 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 NT5C3BQ969T7 300 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 RAB17Q9H0T7 212 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 CERS4Q9HA82 394 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 OSER1Q9NX31 292 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 KRIT1O00522 736 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 CAPN9O14815 690 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 DIAPH2O60879 1101 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 AGTP01019 485 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 IRS1P35568 1242 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 SLC25A52Q3SY17 297 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 TMEM109Q9BVC6 243 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 PBX4Q9BYU1 374 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 SCML2Q9UQR0 700 aa25.28■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 A0A1W2PQH9 124 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 RARAP10276 462 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 PCK1P35558 622 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 TUFMP49411 452 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 KATNAL2Q8IYT4 538 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 KLHL5Q96PQ7 755 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 COX16Q9P0S2 106 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 GMIPQ9P107 970 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 YIPF1Q9Y548 306 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 SLC38A8A6NNN8 435 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 TGM5O43548 720 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 OAS1P00973 400 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 CMPK2Q5EBM0 449 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 LRRC38Q5VT99 294 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 BNIPLQ7Z465 357 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 TLR9Q9NR96 1032 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU1-201ENST00000421832 FAM92AA1XBS5 289 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.26■■□□□ 1.63
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CTU1-201ENST00000421832 YWHAQP27348 245 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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CTU1-201ENST00000421832 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 IRAK3Q9Y616 596 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 M0QYT0 321 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 TAF10Q12962 218 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 C6orf118Q5T5N4 469 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 POLNQ7Z5Q5 900 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 SLC7A14Q8TBB6 771 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF3Q9NR81 526 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 PRRG1O14668 218 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 SNX3O60493 162 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 KRT1P04264 644 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 ERVK-21P61565 698 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 CREMQ03060 361 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 BNIP1Q12981 228 aa25.25■■□□□ 1.63
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CTU1-201ENST00000421832 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 TCEAL8Q8IYN2 117 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 FBXO32Q969P5 355 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 MAGEB5Q9BZ81 275 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 ECT2Q9H8V3 914 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 PIGVQ9NUD9 493 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 STAP1Q9ULZ2 295 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CTU1-201ENST00000421832 RB1P06400 928 aa25.24■■□□□ 1.63
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