RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421051.1

AP000289.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000289.1, Length 1,361 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000289.1-201ENST00000421051 CYP4F3Q08477 520 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 MGAT5Q09328 741 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 RAPGEF1Q13905 1077 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 TEAD2Q15562 447 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 PMS2CLQ68D20 193 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM154Q6P9G4 183 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 NELFCDQ8IXH7 590 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 KIF2BQ8N4N8 673 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF398Q8TD17 642 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 RFFLQ8WZ73 363 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ART4Q93070 314 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 E2F7Q96AV8 911 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 CPB2Q96IY4 423 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 RMDN2Q96LZ7 410 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 DCBLD2Q96PD2 775 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 PNMA5Q96PV4 448 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 HAPLN3Q96S86 360 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 TRPV4Q9HBA0 871 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 SAR1AQ9NR31 198 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 PCMTD2Q9NV79 361 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 BARHL2Q9NY43 387 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ATXN10Q9UBB4 475 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 SCOCQ9UIL1 159 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 AMFRQ9UKV5 643 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 STK24Q9Y6E0 443 aa10□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 BPTFQ12830 3046 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ESYT2A0FGR8 921 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM120BA0PK00 339 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 CAPN9O14815 690 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 CHMP2AO43633 222 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 CREB3O43889 395 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 MOSPD3O75425 235 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 DCTN3O75935 186 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 GM2AP17900 193 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 NAPAP54920 295 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ARPP19P56211 112 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 TNK2Q07912 1038 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 HYIQ5T013 277 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 VPS36Q86VN1 386 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 STKLD1Q8NE28 680 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 FBXO25Q8TCJ0 367 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 RAD54LQ92698 747 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 MTMR9Q96QG7 549 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 SYT11Q9BT88 431 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 CYP4F11Q9HBI6 524 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 CACNA1EQ15878 2313 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 SMCO2A6NFE2 343 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 DPYSL4O14531 572 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 TJP3O95049 919 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 APBB3O95704 486 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 FGGP02679 453 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 PYGLP06737 847 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 BCKDHBP21953 392 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 MUTP22033 750 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ABCG1P45844 678 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 DNA2P51530 1060 aa9.98□□□□□ -0.81
AP000289.1-201ENST00000421051 ADCY7P51828 1080 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms