RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 OR12D3Q9UGF7 316 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ACSL4O60488 711 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 FGGP02679 453 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 TPI1P60174 286 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 SEMA3BQ13214 749 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CREG2Q8IUH2 290 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CEP112Q8N8E3 955 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ITFG1Q8TB96 612 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 TSC1Q92574 1164 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 FAF2Q96CS3 445 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 MSLNLQ96KJ4 702 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 TDP1Q9NUW8 608 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 DONSONQ9NYP3 566 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 STIM2Q9P246 746 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 TRANK1O15050 2925 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF185O15231 689 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 DAPK3O43293 454 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 IRF1P10914 325 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 KCNQ1P51787 676 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ING5Q8WYH8 240 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 APOL5Q9BWW9 433 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 SIK2Q9H0K1 926 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 GKN1Q9NS71 199 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 HS3ST4Q9Y661 456 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 NOTCH4Q99466 2003 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 E2F8A0AVK6 867 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CREB3O43889 395 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 FOSL2P15408 326 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 RFX8Q6ZV50 586 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 HTR3DQ70Z44 454 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CHSY1Q86X52 802 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 RFX6Q8HWS3 928 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 NPAS3Q8IXF0 933 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 TTC13Q8NBP0 860 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 SMRP1Q8NCR6 262 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 RNF157Q96PX1 679 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 RETREG1Q9H6L5 497 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CD207Q9UJ71 328 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CDH7Q9ULB5 785 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 C2orf16Q68DN1 1984 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 F5H5T6 163 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 I6L893 689 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 LEFTY2O00292 366 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CD48P09326 243 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 HOXC13P31276 330 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 PIK3R6Q5UE93 754 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 BBS12Q6ZW61 710 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 DENND1CQ8IV53 801 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 MYLIPQ8WY64 445 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 CFAP97Q9P2B7 532 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 E9PAM4 449 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 APOL1O14791 398 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 LRIG2O94898 1065 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 GOT1P17174 413 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 LTBRP36941 435 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 USP4Q13107 963 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 RABGAP1LQ5R372 815 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ADGRF1Q5T601 910 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 MANEALQ5VSG8 457 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 KAZNQ674X7 775 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 AADACL2Q6P093 401 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 Q6ZNB5 142 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 FGF13Q92913 245 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-202ENST00000397396 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms