RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 CAPN9O14815 690 aa3.6□□□□□ -1.83
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SNORD17-201ENST00000390930 TBL1XO60907 577 aa3.6□□□□□ -1.83
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SNORD17-201ENST00000390930 KIAA1211LQ6NV74 962 aa3.6□□□□□ -1.83
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SNORD17-201ENST00000390930 ARCQ7LC44 396 aa3.6□□□□□ -1.83
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SNORD17-201ENST00000390930 ALLCQ8N6M5 410 aa3.6□□□□□ -1.83
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SNORD17-201ENST00000390930 C3orf20Q8ND61 904 aa3.6□□□□□ -1.83
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SNORD17-201ENST00000390930 DDI1Q8WTU0 396 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNORD17-201ENST00000390930 ALG14Q96F25 216 aa3.6□□□□□ -1.83
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