RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368102.5

SNHG28-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SNHG28, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28-201ENST00000368102 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.52□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.52□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 SPTLC1O15269 473 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 METTL18O95568 372 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 IL1BP01584 269 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 RINLQ6ZS11 566 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 APOPT1Q96IL0 206 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 PIRO00625 290 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 MYL2P10916 166 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 CCDC130P13994 396 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 LMO2P25791 158 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ADORA2BP29275 332 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 PSEN2P49810 448 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 PDK2Q15119 407 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 CHSY1Q86X52 802 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 KPNA7A9QM74 516 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 F8W8V4 182 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ZBED1O96006 694 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 CD4P01730 458 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 AXLP30530 894 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 SERPINB4P48594 390 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 RAP1GDS1P52306 607 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 BCAR1P56945 870 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 BEX3Q00994 111 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 CCL14Q16627 93 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 MROH9Q5TGP6 573 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 E2F8A0AVK6 867 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 MYL3P08590 195 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 RARBP10826 455 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 HDAC4P56524 1084 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 SNX16P57768 344 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ZBTB16Q05516 673 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 UBXN11Q5T124 520 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 PHC3Q8NDX5 983 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 HMX2A2RU54 273 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 HAS3O00219 553 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 MAGEC1O60732 1142 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 CUL3Q13618 768 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF534Q76KX8 674 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 GBP5Q96PP8 586 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 TBCBQ99426 244 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 SMAPO00193 183 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 COPEO14579 308 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 APOL1O14791 398 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 LCP1P13796 627 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 TSHRP16473 764 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 RABGGTBP53611 331 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 BCAT1P54687 386 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 POLE2P56282 527 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 SLC18A2Q05940 514 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 OLIG2Q13516 323 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 USP6NLQ92738 828 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 KRT82Q9NSB4 513 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 RFPL1O75677 317 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG28-201ENST00000368102 DESP17661 470 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms