RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 BAG5Q9UL15 447 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01548A6NM66 108 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM232C9JQI7 657 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 E7EVH7 732 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BNC9 293 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROP1O75360 226 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TK1P04183 234 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS41P49754 854 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTR2P61160 394 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC14A1Q13336 389 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDCLQ13371 301 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CUL4BQ13620 913 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAF12Q16514 161 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 AWAT1Q58HT5 328 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO42Q6P3S6 717 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYT13Q7L8C5 426 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB12Q8WXK4 309 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RILPL2Q969X0 211 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 KAZALD1Q96I82 304 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB2Q96Q27 587 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM2Q9C040 744 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCND3Q9UK17 655 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 FEM1BQ9UK73 627 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAFFQ9ULX9 164 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC12A4Q9UP95 1085 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC189A1A4V9 331 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGAP5A6NIR3 686 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRYO14603 147 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP3A4P08684 503 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP2D6P10635 497 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEPDP12955 493 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RXRAP19793 462 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAT6P42226 847 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPK9P45984 424 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCP4P48539 62 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGTR2P50052 363 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RCAN1P53805 252 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROK1P58294 105 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAB1Q13480 694 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROSER3Q2NL68 480 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RANBP10Q6VN20 620 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHSY1Q86X52 802 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAS2Q8IYD9 372 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 HASPINQ8TF76 798 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZG16BQ96DA0 208 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGSQ96S52 555 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUAK2Q9H093 628 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASSF1Q9NS23 344 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRN3Q9NYV6 651 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms