RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360564.5

MMP17-201, Transcript of matrix metallopeptidase 17, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP17, Length 2,411 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17-201ENST00000360564 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.42■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 FAM72BQ86X60 149 aa21.42■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 DYDC1Q8WWB3 177 aa21.42■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 TTPALQ9BTX7 342 aa21.42■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.42■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 CSF2RAP15509 400 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 RBL1P28749 1068 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 CCDC38Q502W7 563 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 CEP128Q6ZU80 1094 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 NUP93Q8N1F7 819 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 NETO2Q8NC67 525 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 NTAN1Q96AB6 310 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 USP29Q9HBJ7 922 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 IFNAR2P48551 515 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 LBX1P52954 281 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 SCD5Q86SK9 330 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 RNF34Q969K3 372 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 NMUR1Q9HB89 426 aa21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 H3BRJ5 948 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 AIF1P55008 147 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 USP46P62068 366 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 MORF4L2Q15014 288 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 SPRED3Q2MJR0 410 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 C8orf48Q96LL4 319 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 20.9
MMP17-201ENST00000360564 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 CWH43Q9H720 699 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 DTLQ9NZJ0 730 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 A0A1W2PQH9 124 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 CXCR3P49682 368 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 KYNUQ16719 465 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 CCDC77Q9BR77 488 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.4■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 TMEM120BA0PK00 339 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 MTMR11A4FU01 709 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 GSTA1P08263 222 aa21.39■■□□□ 1.02
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MMP17-201ENST00000360564 GPR17Q13304 367 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 RFX8Q6ZV50 586 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 RELL1Q8IUW5 271 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 CPT1BQ92523 772 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 TOP1MTQ969P6 601 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 OSER1Q9NX31 292 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.39■■□□□ 1.02
MMP17-201ENST00000360564 TBC1D4O60343 1298 aa21.39■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 RFC2P35250 354 aa21.39■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 MAGEA11P43364 429 aa21.39■■□□□ 1.01
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MMP17-201ENST00000360564 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.39■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 NINJ2Q9NZG7 142 aa21.39■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 COL4A6Q14031 1691 aa21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 H7C4K7 107 aa21.38■■□□□ 1.01
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MMP17-201ENST00000360564 TIMP1P01033 207 aa21.38■■□□□ 1.01
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MMP17-201ENST00000360564 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 CASP10Q92851 521 aa21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 C9orf72Q96LT7 481 aa21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 C2CD2LO14523 706 aa21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 C1QTNF8P60827 252 aa21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 DUSP4Q13115 394 aa21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 BEND5Q7L4P6 421 aa21.38■■□□□ 1.01
MMP17-201ENST00000360564 PCGF5Q86SE9 256 aa21.38■■□□□ 1.01
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