RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
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SH3BP1-201ENST00000357436 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
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SH3BP1-201ENST00000357436 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
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SH3BP1-201ENST00000357436 A6NHS1 94 aa19.33■□□□□ 0.68
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SH3BP1-201ENST00000357436 E2F7Q96AV8 911 aa19.33■□□□□ 0.68
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SH3BP1-201ENST00000357436 GCKP35557 465 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 CLCNKBP51801 687 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 OCRLQ01968 901 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 BST2Q10589 180 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 ATG16L1Q676U5 607 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 CYS1Q717R9 158 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 KATNAL1Q9BW62 490 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-201ENST00000357436 H0Y3Z8 333 aa19.32■□□□□ 0.68
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