RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R16AQ96I34 528 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PLIN2Q99541 437 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 GTSE1Q9NYZ3 720 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 GLS2Q9UI32 602 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB22O15209 634 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PDHA1P08559 390 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 FAM200BP0CF97 657 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.63e-12■■■■■ 70.5
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PTPRD-201ENST00000355233 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.03□□□□□ -1.6
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