RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ANPEPP15144 967 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 GRK2P25098 689 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF410Q86VK4 478 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ERO1BQ86YB8 467 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 KBTBD2Q8IY47 623 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PPTC7Q8NI37 304 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 UCMAQ8WVF2 138 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ATP2A3Q93084 1043 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 IFT43Q96FT9 208 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 KAT6AQ92794 2004 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 TPP1O14773 563 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PPEF2O14830 753 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL2O95198 593 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ACADSBP45954 432 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 AP2B1P63010 937 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PCLAFQ15004 111 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 OR52E8Q6IFG1 317 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 CLEC4CQ8WTT0 213 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 OTUD5Q96G74 571 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 THTPAQ9BU02 230 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SLC24A3Q9HC58 644 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC28Q9NX36 388 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SLC1A6P48664 564 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 AAGABQ6PD74 315 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 GATA6Q92908 595 aa23.2■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 ITM2AO43736 263 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 FKBP6O75344 327 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 PROCP04070 461 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 PRKCGP05129 697 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 GOT1P17174 413 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 ARL4AP40617 200 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 GLUD2P49448 558 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 MXRA7P84157 204 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 ARMCX2Q7L311 632 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 ISL2Q96A47 359 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 HSFY1Q96LI6 401 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 ELP3Q9H9T3 547 aa23.2■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 BEST2Q8NFU1 509 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 OR6B3Q8NGW1 331 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 CLPTM1LQ96KA5 538 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 YIPF3Q9GZM5 350 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.19■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 MAGEA13PA6NCF6 341 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 MFSD11O43934 449 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 FESP07332 822 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEA12P43365 314 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf146Q5VVC0 180 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 C16orf46Q6P387 395 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 SORT1Q99523 831 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 APOL6Q9BWW8 343 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 NDE1Q9NXR1 346 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 RNF103O00237 685 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 MGAT1P26572 445 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 CRABP2P29373 138 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 MATKP42679 507 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 BTKQ06187 659 aa23.18■■□□□ 1.3
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