RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 VEGFDO43915 354 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 DIRAS3O95661 229 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 F13A1P00488 732 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 FHP07954 510 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PCSK2P16519 638 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 GJA1P17302 382 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CKMT2P17540 419 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TAS2R40P59535 323 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PMP22Q01453 160 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SEC23AQ15436 765 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CCDC142Q17RM4 750 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TTMPQ5BVD1 217 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SGO1Q5FBB7 561 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CMIPQ8IY22 773 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 MIER2Q8N344 545 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 HMCESQ96FZ2 354 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SCLYQ96I15 445 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TESK2Q96S53 571 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 APOL6Q9BWW8 343 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TREM1Q9NP99 234 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CAPN11Q9UMQ6 739 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SOX13Q9UN79 622 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 ZFYVE9O95405 1425 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PTGES3LE9PB15 166 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 ZNF263O14978 683 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 VILLO15195 856 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 OGTO15294 1046 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TOMM70O94826 608 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 IFNA14P01570 189 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 NFICP08651 508 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CSF1P09603 554 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 JUPP14923 745 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 ATF6P18850 670 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PSMC6P62333 389 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PTK2Q05397 1052 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 NPRL3Q12980 569 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 MAMLD1Q13495 774 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PON2Q15165 354 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 NDUFA5Q16718 116 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SGO2Q562F6 1265 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 POTEAQ6S8J7 498 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 LYPD8Q6UX82 237 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CCDC25Q86WR0 208 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SPDL1Q96EA4 605 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 WNK4Q96J92 1243 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PANX2Q96RD6 677 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CYTH2Q99418 400 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 NEK6Q9HC98 313 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 JCADQ9P266 1359 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 DBX1A6NMT0 343 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 SNTNA6NMZ2 147 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 ANGPT2O15123 496 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 KMOO15229 486 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-202ENST00000327307 PLA2G6O60733 806 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms