RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 CHADO15335 359 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ADAM12O43184 909 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 MSI1O43347 362 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TMEM63AO94886 807 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 CCR1P32246 355 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ARL4CP56559 192 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 WDR5P61964 334 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 GAD2Q05329 585 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 KCNJ11Q14654 390 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PPP2R5DQ14738 602 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 CCDC110Q8TBZ0 833 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 FBXO32Q969P5 355 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF558Q96NG5 402 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 SERPINB11Q96P15 392 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 RAB6BQ9NRW1 208 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 RAD54BQ9Y620 910 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 WDR27A2RRH5 827 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 LRIG2O94898 1065 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 KIAA1841Q6NSI8 718 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TMEM199Q8N511 208 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 HTR3CQ8WXA8 447 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TTC25Q96NG3 672 aa28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 VAV1P15498 845 aa28.86■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 C6orf118Q5T5N4 469 aa28.86■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 SLC39A11Q8N1S5 342 aa28.86■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 LGMNQ99538 433 aa28.86■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 SOD2P04179 222 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ABHD2P08910 425 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 CAPN2P17655 700 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 OR1D2P34982 312 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PGM2Q96G03 612 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 KLC2Q9H0B6 622 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PSD3Q9NYI0 1048 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 CLIC5Q9NZA1 410 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 NUP205Q92621 2012 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TLDC2A0PJX2 215 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 E7ESA3 106 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 RASGRF2O14827 1237 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 RPL17P18621 184 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 EPHB2P29323 1055 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 GLUD2P49448 558 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PSEN1P49768 467 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TAF10Q12962 218 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 FNBP1LQ5T0N5 605 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 FAM182AQ5T1J6 154 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PAGE1O75459 146 aa28.84■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 MAGEA6P43360 314 aa28.84■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ZBED8Q8IZ13 594 aa28.84■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 NETO2Q8NC67 525 aa28.84■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TMEM169Q96HH4 297 aa28.84■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TLR6Q9Y2C9 796 aa28.84■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 KCNU1A8MYU2 1149 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ACRP10323 421 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 NR1D1P20393 614 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 EMC10Q5UCC4 262 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 PDIK1LQ8N165 341 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 TLCD1Q96CP7 247 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 CEP295NLQ96MC4 621 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 FERMT1Q9BQL6 677 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 SIK2Q9H0K1 926 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ETNK1Q9HBU6 452 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 A0A0A0MRY4 1105 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 NCAM2O15394 837 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 BAIAP3O94812 1187 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 LAG3P18627 525 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 HTR7P34969 479 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 AP1B1Q10567 949 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 MSS51Q4VC12 460 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 KDM7AQ6ZMT4 941 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 CCDC13Q8IYE1 715 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 VPS52Q8N1B4 723 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 NPWQ8N729 165 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 P2RY11Q96G91 374 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 SPATA13Q96N96 652 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 CLSTN3Q9BQT9 956 aa28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
CCZ1-201ENST00000325974 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms