RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 CREB3O43889 395 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 KRT10P13645 584 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 FSHRP23945 695 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 IL4RP24394 825 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC11A2P49281 568 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 MMRN1Q13201 1228 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 SEMA3BQ13214 749 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 COL19A1Q14993 1142 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 GPR153Q6NV75 609 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 EP400NLQ6ZTU2 488 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 CEP112Q8N8E3 955 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 AZIN2Q96A70 460 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 HELZP42694 1942 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 TBX10O75333 385 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 IRF1P10914 325 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 GOT1P17174 413 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 RFX6Q8HWS3 928 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 MNS1Q8NEH6 495 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 ING5Q8WYH8 240 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 RNF157Q96PX1 679 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 DCLK3Q9C098 648 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM72CH0Y354 149 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 HTR7P34969 479 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 HCAR3P49019 387 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 TPI1P60174 286 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 TFDP2Q14188 446 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM72AQ5TYM5 149 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 PIK3R6Q5UE93 754 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM72DQ6L9T8 149 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM72BQ86X60 149 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 HERPUD2Q9BSE4 406 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 S1PR5Q9H228 398 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 ACSL4O60488 711 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 LRIG2O94898 1065 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 LATS1O95835 1130 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 ZXDBP98169 803 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 RFX8Q6ZV50 586 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 DENND1CQ8IV53 801 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 KRIT1O00522 736 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 DAPK3O43293 454 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 KLKB1P03952 638 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 GGCXP38435 758 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 LRRC31Q6UY01 552 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 BBS12Q6ZW61 710 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 RIPOR3Q96MK2 946 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 CARD6Q9BX69 1037 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 TDP1Q9NUW8 608 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 STIM2Q9P246 746 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC71L-201ENST00000315965 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 CST8O60676 142 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 CTAGE8P0CG41 777 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 LTBRP36941 435 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 CFAP97Q9P2B7 532 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF510Q9Y2H8 683 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 SZT2Q5T011 3432 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 REV3LO60673 3130 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 E9PAM4 449 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 LEFTY2O00292 366 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 APOL1O14791 398 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 EPHB2P29323 1055 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC71L-201ENST00000315965 WEE1P30291 646 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms