RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 OSER1Q9NX31 292 aa23.5■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 IRAK2O43187 625 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 MSI1O43347 362 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SOAT2O75908 522 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CCNYQ8ND76 341 aa23.49■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 OR6C75A6NL08 312 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 E7EVH7 732 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM66O15016 1216 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CDH16O75309 829 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 HCAR3P49019 387 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 USP46P62068 366 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 VPS52Q8N1B4 723 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 P2RY11Q96G91 374 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 LRIG2O94898 1065 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CPB1P15086 417 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CREB1P16220 341 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PDK1Q15118 436 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 NPWQ8N729 165 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CEP41Q9BYV8 373 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 EURLQ9NYK6 297 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 LGALS13Q9UHV8 139 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.48■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ELK3P41970 407 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA6P43360 314 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN26Q16670 478 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 C4orf22Q6V702 233 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TOX2Q96NM4 488 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 EPAS1Q99814 870 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CRISPLD1Q9H336 500 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SMOC2Q9H3U7 446 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SCML2Q9UQR0 700 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0A0MRY4 1105 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 F5H423 210 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 EPHB2P29323 1055 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA11P43364 429 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 GLUD2P49448 558 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PALM2Q8IXS6 379 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC43Q8N309 656 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA13Q96N96 652 aa23.47■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SIK2Q9H0K1 926 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.46■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR11A4FU01 709 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 RNF103O00237 685 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D4O60343 1298 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PIAS1O75925 651 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 VNN2O95498 520 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 CHN1P15882 459 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 ATP5DP30049 168 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 BCAS4Q8TDM0 211 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 VWCEQ96DN2 955 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.45■■□□□ 1.35
VSTM4-201ENST00000298454 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 SEC24CP53992 1094 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 WASHC5Q12768 1159 aa23.45■■□□□ 1.34
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VSTM4-201ENST00000298454 TMED2Q15363 201 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FOXR1Q6PIV2 292 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MON1AQ86VX9 555 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FBF1Q8TES7 1133 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TTPALQ9BTX7 342 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 OSBPL2Q9H1P3 480 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 GMIPQ9P107 970 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 TBX21Q9UL17 535 aa23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PHBP35232 272 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 GPR17Q13304 367 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 MGAT5BQ3V5L5 792 aa23.44■■□□□ 1.34
VSTM4-201ENST00000298454 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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