RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290417.6

GFRA4-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA4, Length 1,427 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4-201ENST00000290417 STARD13Q9Y3M8 1113 aa23.47■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 ABCB4P21439 1286 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 TNFAIP3P21580 790 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 FLT3P36888 993 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 MRE11P49959 708 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 RAP1GAP2Q684P5 730 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 LONP2Q86WA8 852 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 CHSY1Q86X52 802 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 CAMKK1Q8N5S9 505 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 STIM2Q9P246 746 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 HCN2Q9UL51 889 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 DMDP11532 3685 aa23.46■■□□□ 1.35
GFRA4-201ENST00000290417 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 KCNU1A8MYU2 1149 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 SGK1O00141 431 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 LILRB5O75023 590 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 HOXA6P31267 233 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 PTP4A2Q12974 167 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 GEN1Q17RS7 908 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 EOGTQ5NDL2 527 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 LGI2Q8N0V4 545 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 MYEOVQ96EZ4 313 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 ADAM33Q9BZ11 813 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 PIGVQ9NUD9 493 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.45■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 APBB3O95704 486 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 TPM3P06753 285 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 TACR2P21452 398 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 CRY1Q16526 586 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 MPP7Q5T2T1 576 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 TRNP1Q6NT89 227 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 TMEM92Q6UXU6 159 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 CFAP52Q8N1V2 620 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 EMC1Q8N766 993 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 TSTD1Q8NFU3 115 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 NT5C3BQ969T7 300 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 TBCBQ99426 244 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 EML5Q05BV3 1969 aa23.44■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 ADAM23O75077 832 aa23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 CALB1P05937 261 aa23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 WASP42768 502 aa23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 DEUP1Q05D60 604 aa23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 ARCQ7LC44 396 aa23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 WDR5BQ86VZ2 330 aa23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 SYT11Q9BT88 431 aa23.43■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 A0A1W2PQJ5 194 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 PRR23AA6NEV1 266 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 GFRA3O60609 400 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 GJB6O95452 261 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 HLA-FP30511 346 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 NTSR1P30989 418 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 PRKCIP41743 596 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 DGKEP52429 567 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 MON1BQ7L1V2 547 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 ASCL5Q7RTU5 278 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 MFN1Q8IWA4 741 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 CHPFQ8IZ52 775 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 WFDC5Q8TCV5 224 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 ACOX2Q99424 681 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 USP34Q70CQ2 3546 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 F5H5T6 163 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 CBFA2T2O43439 604 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 F9P00740 461 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 LMNAP02545 664 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 SKILP12757 684 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 CXCR3P49682 368 aa23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GFRA4-201ENST00000290417 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms