RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289672.6

PKD1L1-201, Transcript of polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKD1L1, Length 9,092 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L1-201ENST00000289672 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ETAA1Q9NY74 926 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 AFF2P51816 1311 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 DDHD2O94830 711 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 KCNA6P17658 529 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 MYL9P24844 172 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 HOXC8P31273 242 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 NR1I3Q14994 352 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 MAPK11Q15759 364 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC9A6Q92581 669 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 C3orf18Q9UK00 162 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 IQGAP1P46940 1657 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CHRNGP07510 517 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 HOXC6P09630 235 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CYP2C9P11712 490 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CPT1AP50416 773 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CACNA2D1P54289 1103 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC34A1Q06495 639 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 BROXQ5VW32 411 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 C11orf74Q86VG3 221 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 USP7Q93009 1102 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 MCUBQ9NWR8 336 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 RAD51CO43502 376 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 LRG1P02750 347 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CCNIQ14094 377 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 EFR3AQ14156 821 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ITCHQ96J02 903 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 GGT7Q9UJ14 662 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 AKAP12Q02952 1782 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PCNAP12004 261 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PEX6Q13608 980 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 TRPV1Q8NER1 839 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.93□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 AQP5P55064 265 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 GPSM2P81274 684 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PLD1Q13393 1074 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PACS1Q6VY07 963 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 HAO1Q9UJM8 370 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 MAGEB3O15480 346 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PLIN5Q00G26 463 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 MCL1Q07820 350 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SGF29Q96ES7 293 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 RASSF1Q9NS23 344 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 NAGPAQ9UK23 515 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CDH9Q9ULB4 789 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 HOXA2O43364 376 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SERPINA1P01009 418 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 PDGFRBP09619 1106 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ATF6P18850 670 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 UGT1A5P35504 534 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 ALDH3A2P51648 485 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CHN2P52757 468 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 BCAT1P54687 386 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 CDC42P60953 191 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 RFX4Q33E94 735 aa8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms