RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 UBE4BO95155 1302 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CAPN14A8MX76 684 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ATP9BO43861 1147 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 PSMC3P17980 439 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 PPP2R5DQ14738 602 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CDO1Q16878 200 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 IFNL1Q8IU54 200 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ABHD8Q96I13 439 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 OSMRQ99650 979 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 PLLPQ9Y342 182 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 A0A0B4J269 797 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 GIPC1O14908 333 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SIN3BO75182 1162 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 INSRRP14616 1297 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ARPP19P56211 112 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SREBF2Q12772 1141 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 EML3Q32P44 896 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CDRT15Q96T59 188 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TINF2Q9BSI4 451 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 MYPNQ86TC9 1320 aa11.14□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CROCCQ5TZA2 2017 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1B0GTW7 788 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ITM2AO43736 263 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 PSMD10O75832 226 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SAT1P21673 171 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SLC5A2P31639 672 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ETV4P43268 484 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 MTTPP55157 894 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ESRRGP62508 458 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TCEAL1Q15170 157 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 LRRC43Q8N309 656 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CHST13Q8NET6 341 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ATP2A3Q93084 1043 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJB4Q9UDY4 337 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 LAMB2P55268 1798 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 H3BRB1 525 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CYP2C9P11712 490 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 GTF2H1P32780 548 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 NR1H2P55055 460 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ART3Q13508 389 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 AMHR2Q16671 573 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 NPNTQ6UXI9 565 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 HASPINQ8TF76 798 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ADA2Q9NZK5 511 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CACNG4Q9UBN1 327 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.13□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJA2O60884 412 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 HSPA4LO95757 839 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CD48P09326 243 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 MX2P20592 715 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SLC1A6P48664 564 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 GPC3P51654 580 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 CDH15P55291 814 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 NOGQ13253 232 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 NFIL3Q16649 462 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 ADAM32Q8TC27 787 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 MBOAT7Q96N66 472 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SERPINI1Q99574 410 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 THAP1Q9NVV9 213 aa11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CNGA3-201ENST00000272602 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms