RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CXCR3P49682 368 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SULT1E1P49888 294 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SATB1Q01826 763 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 NME3Q13232 169 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CCDC14Q49A88 953 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TERB1Q8NA31 727 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 USP33Q8TEY7 942 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 DDI1Q8WTU0 396 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RXFP2Q8WXD0 754 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 BTN2A3PQ96KV6 586 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 DMDP11532 3685 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PRRT4C9JH25 899 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 KRT3P12035 628 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RRM1P23921 792 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF4P43489 277 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ARTNQ5T4W7 220 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 GRAMD4Q6IC98 578 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 VCPIP1Q96JH7 1222 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC7Q99615 494 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ISCUQ9H1K1 167 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 MYO15AQ9UKN7 3530 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 LAMTOR5O43504 91 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ADCY5O95622 1261 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 APOEP02649 317 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 DGKGP49619 791 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SEC13P55735 322 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 MPP7Q5T2T1 576 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TSSK4Q6SA08 328 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 NELL1Q92832 810 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TRIM5Q9C035 493 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 STARD13Q9Y3M8 1113 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 VPS13AQ96RL7 3174 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3BA6NDS4 549 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 K7ESF4 209 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RTN2O75298 545 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CYBBP04839 570 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SP9P0CG40 484 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A3P11169 496 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PDGFRAP16234 1089 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TACR2P21452 398 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CXCL12P48061 93 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PTPN5P54829 565 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 DEUP1Q05D60 604 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TRIM14Q14142 442 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RAP1GAP2Q684P5 730 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 DRC7Q8IY82 874 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 WFDC5Q8TCV5 224 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 LMLNQ96KR4 655 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A11Q9BYW1 496 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 FBXO4Q9UKT5 387 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 NENFQ9UMX5 172 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 A0A087X0T9 212 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TBL1XO60907 577 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 F9P00740 461 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 FAM228BP0C875 321 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PTPN9P43378 593 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 CCR3P51677 355 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 GEN1Q17RS7 908 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 C2orf27AQ580R0 203 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 TMEM215Q68D42 235 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 IL17RCQ8NAC3 791 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 RNF34Q969K3 372 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 WDCPQ9H6R7 721 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 HS3ST4Q9Y661 456 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-201ENST00000236273 PAGE1O75459 146 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ABCB4P21439 1286 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 HLA-FP30511 346 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 ATP11AP98196 1134 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 OGDHQ02218 1023 aa23.08■■□□□ 1.28
SYF2-201ENST00000236273 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms