RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 ACTL7BQ9Y614 415 aa24.71■■□□□ 1.55
RPUSD1-201ENST00000007264 RAD54BQ9Y620 910 aa24.71■■□□□ 1.55
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM120BA0PK00 339 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 I6L893 689 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM66O15016 1216 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 AVILO75366 819 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM107AO95990 144 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 GCAP28676 217 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 GLUD2P49448 558 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 NETO2Q8NC67 525 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 MCUQ8NE86 351 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 ACSS3Q9H6R3 686 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 FETUBQ9UGM5 382 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 TEX264Q9Y6I9 313 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 FOXO6A8MYZ6 492 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT15P19012 456 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 TPSB2P20231 275 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 FDFT1P37268 417 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 TPSAB1Q15661 275 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 P2RY11Q96G91 374 aa24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 VWA8A3KMH1 1905 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF103O00237 685 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 NCAM2O15394 837 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 OPHN1O60890 802 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 SPAG6O75602 509 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 AMHP03971 560 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 SARNPP82979 210 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 MAML1Q92585 1016 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 SCLYQ96I15 445 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 HIPK3Q9H422 1215 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 TET1Q8NFU7 2136 aa24.69■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 OR6C75A6NL08 312 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 EBAG9O00559 213 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 CREB1P16220 341 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 EPHB2P29323 1055 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP2C18P33260 490 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 SERPINB6P35237 376 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA5AQ13591 1074 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 NUP93Q8N1F7 819 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC3P53804 2025 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 IRAK2O43187 625 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 IGLV3-25P01717 112 aa24.68■■□□□ 1.54
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RPUSD1-201ENST00000007264 RASA2Q15283 850 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 IGDCC3Q8IVU1 814 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 MGARPQ8TDB4 240 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 C8orf48Q96LL4 319 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 CYTH2Q99418 400 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 SMOC2Q9H3U7 446 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO44Q9H4M3 255 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 SCN5AQ14524 2016 aa24.68■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 TBKBP1A7MCY6 615 aa24.67■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC11A1P49279 550 aa24.67■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 ARPP19P56211 112 aa24.67■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 CBLBQ13191 982 aa24.67■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 DDR2Q16832 855 aa24.67■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.67■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
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RPUSD1-201ENST00000007264 CFAP36Q96G28 342 aa24.67■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
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RPUSD1-201ENST00000007264 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.67■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 LRIG2O94898 1065 aa24.66■■□□□ 1.54
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RPUSD1-201ENST00000007264 MSH2P43246 934 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 CCL23P55773 120 aa24.66■■□□□ 1.54
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RPUSD1-201ENST00000007264 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 34.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC39Q96DD0 335 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 B3GALT6Q96L58 329 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 PAFAH2Q99487 392 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 SIK2Q9H0K1 926 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1W2PQH9 124 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 CPP00450 1065 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 MX2P20592 715 aa24.66■■□□□ 1.54
RPUSD1-201ENST00000007264 CCR1P32246 355 aa24.66■■□□□ 1.54
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