RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	GTF2A2	P52657	109 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	LILRA4	P59901	499 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	BST1	Q10588	318 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	OLIG2	Q13516	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	INPP5D	Q92835	1189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152		M0QYT0	321 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ENTPD5	O75356	428 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEA3	P43357	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEA6	P43360	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PARP6	Q2NL67	630 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CES4A	Q5XG92	561 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MIPEP	Q99797	713 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152		I3L4J1	428 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	F2	P00734	622 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN4	P29074	926 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ACADSB	P45954	432 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD10	Q14728	455 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TTC8	Q8TAM2	541 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	P2RY11	Q96G91	374 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TNIP3	Q96KP6	325 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SYT17	Q9BSW7	474 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	IPP	Q9Y573	584 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0A0MRY4	1105 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	KCNK1	O00180	336 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RNF103	O00237	685 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MYL3	P08590	195 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TPSB2	P20231	275 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MGAT1	P26572	445 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CPA2	P48052	419 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CDK16	Q00536	496 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RNF139	Q8WU17	664 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA13	Q96N96	652 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN18	Q99952	460 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RARB	P10826	455 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PSMB4	P28070	264 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SLC8A3	P57103	927 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	USP12	O75317	370 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CDC25C	P30307	473 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ELF1	P32519	619 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	GMPR	P36959	345 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SV2C	Q496J9	727 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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