RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 OASLQ15646 514 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM72AQ5TYM5 149 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM72DQ6L9T8 149 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM72BQ86X60 149 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 IFT20Q8IY31 132 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 GRK7Q8WTQ7 553 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 HAPLN3Q96S86 360 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 OSBPL2Q9H1P3 480 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCH2Q9P0N8 246 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BNC9 293 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 LPXNO60711 386 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 ECEL1O95672 775 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 C1RP00736 705 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF8P28908 595 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP3CCP48454 512 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 HCAR3P49019 387 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCN4P51793 760 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 VCPP55072 806 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX4P57082 545 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 BRD3Q15059 726 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 TADA2BQ86TJ2 420 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC14L1Q92503 715 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM51Q9BSJ1 452 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC151A5D8V7 595 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 CREB3O43889 395 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 C8AP07357 584 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A3P11169 496 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 AMPD1P23109 780 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 GPM6BQ13491 265 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 NOMO1Q15155 1222 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 NPNTQ6UXI9 565 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 P3H4Q92791 437 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 ERP44Q9BS26 406 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 PBX4Q9BYU1 374 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB17Q9H0T7 212 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 OR12D3Q9UGF7 316 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-215ENST00000628018 PAGE1O75459 146 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 LRG1P02750 347 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBP50607 506 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 LMNB2Q03252 620 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 DPYSQ14117 519 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 HECTD3Q5T447 861 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHDC10Q6PID8 442 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 RFX8Q6ZV50 586 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ESYT3A0FGR9 886 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV3-27P01718 113 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGAVP06756 1048 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 DUPD1Q68J44 220 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM150AQ86TG1 271 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MIB1Q86YT6 1006 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC114Q96M63 670 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 EPAS1Q99814 870 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ETNK2Q9NVF9 386 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 DNMT3LQ9UJW3 386 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF148Q9UQR1 794 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 NEU2Q9Y3R4 380 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX10Q9Y5X0 201 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 F11P03951 625 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 TPI1P60174 286 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 RING1Q06587 406 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 TRADDQ15628 312 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 RTL10Q7L3V2 364 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 IL21Q9HBE4 155 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC12A8A0AV02 714 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MCF2LO15068 1137 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 LRIG2O94898 1065 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 GAS8O95995 478 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 MYBL2P10244 700 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCN6P51797 869 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R7Q15435 360 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf74Q96LT6 269 aa25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms