RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 ESX1Q8N693 406 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 WASF1Q92558 559 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 STK33Q9BYT3 514 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 TDP1Q9NUW8 608 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A1W2PQJ5 194 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 HMX2A2RU54 273 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 EPOPA6NHQ4 379 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIM38O00635 465 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 OPHN1O60890 802 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 CSPG5O95196 566 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 MSL3P1P0C860 447 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 ELF1P32519 619 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC6A11P48066 632 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 JAK3P52333 1124 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 MGAT2Q10469 447 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 TIGD6Q17RP2 521 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPRED2Q7Z698 418 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 CRYGNQ8WXF5 182 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 IRF7Q92985 503 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 RIT2Q99578 217 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4DIP-241ENST00000616206 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 DENND3A2RUS2 1198 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 ACKR2O00590 384 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 NPC1O15118 1278 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 VTNP04004 478 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 CEACAM5P06731 702 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 CKMT1AP12532 417 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMOD1P28289 359 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 SFNP31947 248 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRKCEQ02156 737 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 MGAT3Q09327 533 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 ME3Q16798 604 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 Q4G0T1 1027 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 NEK8Q86SG6 692 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 RPAINQ86UA6 219 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 ASB12Q8WXK4 309 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 SEC14L1Q92503 715 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 TOP1MTQ969P6 601 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 LENG9Q96B70 501 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM167AQ96KS9 214 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAP7D2Q96T17 732 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 CENPOQ9BU64 300 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 PADI3Q9ULW8 664 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF318Q5VUA4 2279 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 COL1A2P08123 1366 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 TET1Q8NFU7 2136 aa7.82□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 TISP43B9A030 160 aa7.82□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 B9A039 149 aa7.82□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 K7ENM7 598 aa7.82□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAGEB2O15479 319 aa7.82□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARHGAP6O43182 974 aa7.82□□□□□ -1.16
PDE4DIP-241ENST00000616206 JAK2O60674 1132 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms