RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612161.4

SLC38A1-211, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC38A1, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-211ENST00000612161 CHRNA2Q15822 529 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 BBS12Q6ZW61 710 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 NAT16Q8N8M0 369 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 VPS50Q96JG6 964 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 ART5Q96L15 291 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 NDNQ99608 321 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 FOXB1Q99853 325 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 MIS12Q9H081 205 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 TPK1Q9H3S4 243 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 21.1
SLC38A1-211ENST00000612161 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 IQGAP1P46940 1657 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.53□□□□□ -1.36
SLC38A1-211ENST00000612161 SYNMO15061 1565 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PTP4A3O75365 173 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CSPG5O95196 566 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 EPN2O95208 641 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SNX4O95219 450 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 NDST3O95803 873 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ADRB2P07550 413 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 NFICP08651 508 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CYP2C9P11712 490 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 JUPP14923 745 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CHMP24386 653 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ATP6V1E1P36543 226 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PREPP48147 710 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 FLT3LGP49771 235 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PNLIPRP1P54315 467 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 C21orf58P58505 322 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 S100A12P80511 92 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TEKQ02763 1124 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 RIPK1Q13546 671 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SSPNQ14714 243 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 FUT11Q495W5 492 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TTC23LQ6PF05 361 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 RANBP10Q6VN20 620 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CHSY3Q70JA7 882 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CADM3Q8N126 398 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 P3H4Q92791 437 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 GBA3Q9H227 469 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 C8orf4Q9NR00 106 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 EHD2Q9NZN4 543 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 GULP1Q9UBP9 304 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 INSRP06213 1382 aa6.52□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TMEM82A0PJX8 343 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 CCDC151A5D8V7 595 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 A8MVJ9 347 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 PIP5K1BO14986 540 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ZW10O43264 779 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 STX6O43752 255 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 STARD3NLO95772 234 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ITGA2BP08514 1039 aa6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SLC38A1-211ENST00000612161 ITGB7P26010 798 aa6.51□□□□□ -1.37
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