RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610601.1

FAM27B-201, Transcript of family with sequence similarity 27 member B, humanhuman

BASIC

Gene FAM27B, Length 213 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27B-201ENST00000610601 CTHP32929 405 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GJA4P35212 333 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 MAGEA1P43355 309 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PTPN9P43378 593 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 NOP2P46087 812 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GALK1P51570 392 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GSCP56915 257 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GSDMDP57764 484 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PRKCQQ04759 706 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 KDSRQ06136 332 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 RING1Q06587 406 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 NNTQ13423 1086 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 MAMLD1Q13495 774 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GSE1Q14687 1217 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PON2Q15165 354 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 ARL13BQ3SXY8 428 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 MPPE1Q53F39 396 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 ADGRF1Q5T601 910 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TRNP1Q6NT89 227 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 RFWD3Q6PCD5 774 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 LRRC31Q6UY01 552 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 Q6ZNB5 142 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 ARCQ7LC44 396 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 STRADAQ7RTN6 431 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 CHSY1Q86X52 802 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 FAM131BQ86XD5 332 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TMTC1Q8IUR5 882 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 CCDC170Q8IYT3 715 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 LGI2Q8N0V4 545 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 OLIG1Q8TAK6 271 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 CD101Q93033 1021 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 ARHGEF26Q96DR7 871 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 MSANTD3Q96H12 275 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 SLC39A13Q96H72 371 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 NELL2Q99435 816 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 P2RY13Q9BPV8 354 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 NUP85Q9BW27 656 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PACSIN1Q9BY11 444 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 FOXQ1Q9C009 403 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TKTL2Q9H0I9 626 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TBC1D17Q9HA65 648 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PIGVQ9NUD9 493 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 ANAPC7Q9UJX3 599 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 SIT1Q9Y3P8 196 aa5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 DOCK6Q96HP0 2047 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 OBSL1O75147 1896 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TBC1D3BA6NDS4 549 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 H0Y626 953 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 MYO1FO00160 1098 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 NRDCO43847 1150 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GREM1O60565 184 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TBL1XO60907 577 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PAGE1O75459 146 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 NDUFA10O95299 355 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 IGLV3-25P01717 112 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 APODP05090 189 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 CYP1A2P05177 515 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 DCNP07585 359 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TMEM253P0C7T8 217 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 TYRP14679 529 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GLULP15104 373 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 SLC6A4P31645 630 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GJC1P36383 396 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 GGCXP38435 758 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 SLC6A11P48066 632 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 DGKGP49619 791 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 CXCR3P49682 368 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 SEC13P55735 322 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 HDAC4P56524 1084 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 STARD6P59095 220 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 KRT83P78385 493 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 OGDHQ02218 1023 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 MTA1Q13330 715 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 LRRC32Q14392 662 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PPP2R5DQ14738 602 aa4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
FAM27B-201ENST00000610601 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms