RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TNIP3	Q96KP6	325 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SENP8	Q96LD8	212 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC77	Q9BR77	488 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	LHX5	Q9H2C1	402 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	LRCH4	O75427	683 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB6	Q15916	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	VPS11	Q9H270	941 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RSAD1	Q9HA92	442 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ARL5C	A6NH57	179 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CABYR	O75952	493 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CHRNA3	P32297	505 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GPD2	P43304	727 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SNX16	P57768	344 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TCEAL1	Q15170	157 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	STIL	Q15468	1287 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GDF3	Q9NR23	364 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PODXL	O00592	558 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PTGES	O14684	152 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNE1	P15382	129 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ARL4A	P40617	200 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MAGEA4	P43358	317 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC30A	Q86WT1	665 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	XYLT1	Q86Y38	959 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CD101	Q93033	1021 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RILP	Q96NA2	401 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	COL6A3	P12111	3177 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ACR	P10323	421 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DEUP1	Q05D60	604 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	INCA1	Q0VD86	236 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	EFEMP1	Q12805	493 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MTMR3	Q13615	1198 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	LPIN1	Q14693	890 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GEN1	Q17RS7	908 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC185	Q8N715	623 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MAML1	Q92585	1016 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	AZIN2	Q96A70	460 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CHST12	Q9NRB3	414 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.15	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	PIR	O00625	290 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	PSTPIP1	O43586	416 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	UGT1A9	O60656	530 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	INHBA	P08476	426 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT4	P19013	534 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	TNFRSF8	P28908	595 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	XRCC4	Q13426	336 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	RAPH1	Q70E73	1250 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	TBCB	Q99426	244 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	SCN1A	P35498	2009 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	JCHAIN	P01591	159 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP3A5	P20815	502 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	PTK7	Q13308	1070 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	MTFR1	Q15390	333 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	HIF1A	Q16665	826 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	UNC93A	Q86WB7	457 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CTCFL-222	ENST00000609232	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79

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