RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CEP112	Q8N8E3	955 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	MNS1	Q8NEH6	495 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	COG1	Q8WTW3	980 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	EDEM1	Q92611	657 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	IL21	Q9HBE4	155 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.26	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CEP104	O60308	925 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	PTPN2	P17706	415 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	KDELR1	P24390	212 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CDC25C	P30307	473 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CCR1	P32246	355 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	PGF	P49763	221 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ARSE	P51690	589 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	NTHL1	P78549	312 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TDG	Q13569	410 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	DPYSL2	Q16555	572 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CDO1	Q16878	200 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	MYADM	Q96S97	322 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TLR5	O60602	858 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	OLFM2	O95897	454 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TCF4	P15884	667 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CXCR5	P32302	372 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	HTR7	P34969	479 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	HCAR3	P49019	387 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	COG7	P83436	770 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC181	Q5TID7	509 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TAC4	Q86UU9	113 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ASIC4	Q96FT7	647 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ZWILCH	Q9H900	591 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF185	O15231	689 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	LAMP2	P13473	410 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	L1CAM	P32004	1257 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	CDKN2B	P42772	138 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	MARCKSL1	P49006	195 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CELF4-222	ENST00000601392	NME3	Q13232	169 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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