RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 FOXJ1Q92949 421 aa21.55■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.55■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.55■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 CFIP05156 583 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SERPINF2P08697 491 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 ENGP17813 658 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 IL12RB1P42701 662 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 RGS7P49802 495 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 RRAGAQ7L523 313 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 DEFB119Q8N690 84 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 CIPCQ9C0C6 399 aa21.54■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 BIN1O00499 593 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 CD6P30203 668 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SLC11A2P49281 568 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 ZNF234Q14588 700 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 MPP7Q5T2T1 576 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 KAT5Q92993 513 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 IRAK2O43187 625 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 IGLV3-27P01718 113 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 LTFP02788 710 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 OXTRP30559 389 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 MAPK8P45983 427 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 RING1Q06587 406 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 AZIN2Q96A70 460 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 CAPN10Q9HC96 672 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 ITM2CQ9NQX7 267 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 EPG5Q9HCE0 2579 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.52■■□□□ 1.04
NFIC-209ENST00000589969 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 TSPAN3O60637 253 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 GABBR2O75899 941 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 SYPP08247 313 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 NCAM1P13591 858 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 GNSP15586 552 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 STX17P56962 302 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 MEA1Q16626 185 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 FAM81BQ96LP2 452 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 SLC32A1Q9H598 525 aa21.51■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 UPK3BL1B0FP48 263 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 MED7O43513 233 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 EPHX1P07099 455 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 KRT5P13647 590 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 HLA-FP30511 346 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 ACADSBP45954 432 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 TMEM215Q68D42 235 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 AHI1Q8N157 1196 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 HDDC3Q8N4P3 179 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 STK32AQ8WU08 396 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-209ENST00000589969 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms