RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 GRIK3Q13003 919 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 LIMS2Q7Z4I7 341 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 EXOC3L1Q86VI1 746 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 PPIL6Q8IXY8 311 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 SELENOSQ9BQE4 189 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 EURLQ9NYK6 297 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
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CAPNS1-204ENST00000587718 PIRO00625 290 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A3Q01959 620 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 ATAT1Q5SQI0 421 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 C9orf57Q5W0N0 161 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6B2Q6IFH4 312 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf89Q6UWU4 347 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35F5Q8WV83 523 aa26.39■■□□□ 1.82
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CAPNS1-204ENST00000587718 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 RXFP1Q9HBX9 757 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 SENP1Q9P0U3 644 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP69A5D8W1 941 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM221A6NGB7 291 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 C2CD4DB7Z1M9 353 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 M0R296 226 aa26.38■■□□□ 1.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 URODP06132 367 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 PDGFRAP16234 1089 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 DRD4P21917 467 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ACADSBP45954 432 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC18A1P54219 525 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 DSG1Q02413 1049 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 DPH6Q7L8W6 267 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 EMC1Q8N766 993 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR62Q9BZJ7 368 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX9Q9Y5X1 595 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 E5RJQ4 531 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 C2CD2LO14523 706 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX28O15482 410 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 PRPSAP2O60256 369 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPN9P43378 593 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 GLUD2P49448 558 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 LONRF1Q17RB8 773 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 OLFML1Q6UWY5 402 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 C4orf22Q6V702 233 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR149Q86SP6 731 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 RFX6Q8HWS3 928 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 UBA3Q8TBC4 463 aa26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 CXCL16Q9H2A7 254 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SFXN1Q9H9B4 322 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC24A2Q9UI40 661 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 PTGESO14684 152 aa26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 RECQL4O94761 1208 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SIGLEC14Q08ET2 396 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ORC1Q13415 861 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 NOMO1Q15155 1222 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 GPR65Q8IYL9 337 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ASIC4Q96FT7 647 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM118BQ9BPY3 351 aa26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 E7ESA3 106 aa26.36■■□□□ 1.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLCO1A2P46721 670 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 BCAT1P54687 386 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD52Q8NB46 1076 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 HSFY1Q96LI6 401 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 PAAF1Q9BRP4 392 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNH6Q9H252 994 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SAYSD1Q9NPB0 183 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM28Q9UKQ2 775 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM23A6NLE4 172 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 CPP00450 1065 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL4CP56559 192 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 BST2Q10589 180 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SKIDA1Q1XH10 827 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SV2CQ496J9 727 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-204ENST00000587718 FUT10Q6P4F1 479 aa26.35■■□□□ 1.81
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