RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587167.1

SPHK1-204, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SPHK1, Length 456 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-204ENST00000587167 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 RRN3Q9NYV6 651 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 COX16Q9P0S2 106 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 M0QYT0 321 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 ARNTLO00327 626 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 MAN2B1O00754 1011 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 IRAK2O43187 625 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 GREM1O60565 184 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 IGLV3-25P01717 112 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 MYBL1P10243 752 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 GBP1P32455 592 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 GSE1Q14687 1217 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 ZBTB44Q8NCP5 570 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 MCEEQ96PE7 176 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 NPY6RQ99463 290 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 DCLK3Q9C098 648 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 EBF3Q9H4W6 596 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 PARVAQ9NVD7 372 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 DDIT4Q9NX09 232 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 LILRB5O75023 590 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 IGLV3-27P01718 113 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 KLKB1P03952 638 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 ARSAP15289 507 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 PDGFRAP16234 1089 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 FECHP22830 423 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 GALCP54803 685 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 TNK2Q07912 1038 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 NME3Q13232 169 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 NNTQ13423 1086 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 MAMLD1Q13495 774 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 PDGFRLQ15198 375 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 EML3Q32P44 896 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 Q6ZNB5 142 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 DENND1CQ8IV53 801 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 RUBCNQ92622 972 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 NT5C3BQ969T7 300 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 SLC39A13Q96H72 371 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 TBCBQ99426 244 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 THAP2Q9H0W7 228 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 HPS4Q9NQG7 708 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.34■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 ANKRD62A6NC57 917 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 GPD1P21695 349 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 SDC4P31431 198 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 GSDMDP57764 484 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 RING1Q06587 406 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 RUNX3Q13761 415 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 TTC8Q8TAM2 541 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 ATP2A3Q93084 1043 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 CHRDQ9H2X0 955 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 SCINQ9Y6U3 715 aa20.33■□□□□ 0.85
SPHK1-204ENST00000587167 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-204ENST00000587167 H2AFZP0C0S5 128 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-204ENST00000587167 TDGF1P13385 188 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-204ENST00000587167 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-204ENST00000587167 ATP11AP98196 1134 aa20.32■□□□□ 0.84
SPHK1-204ENST00000587167 DEUP1Q05D60 604 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms