RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SUFU	Q9UMX1	484 aa		18.99	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ADORA2A	P29274	412 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ADORA2B	P29275	332 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PGM1	P36871	562 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PNPLA4	P41247	253 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MATK	P42679	507 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	RAP1GDS1	P52306	607 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CASC4	Q6P4E1	433 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CDCA5	Q96FF9	252 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF560	Q96MR9	790 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SNX25	Q9H3E2	840 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	USP3	Q9Y6I4	520 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CYB561D2	O14569	222 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	AMPD1	P23109	780 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	AQP5	P55064	265 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SNAPC2	Q13487	334 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MUM1	Q2TAK8	710 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	MOB2	Q70IA6	237 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC185	Q8N715	623 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ARMCX1	Q9P291	453 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	18.98	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559		B2RBV5	119 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	GLRA3	O75311	464 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC130	P13994	396 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	GOT1	P17174	413 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PGAM1	P18669	254 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	UTRN	P46939	3433 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	RCN1	Q15293	331 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DGKD	Q16760	1214 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TNIP3	Q96KP6	325 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	FZD10	Q9ULW2	581 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	WDR27	A2RRH5	827 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559		F8W8V4	182 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	STRN	O43815	780 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PSMG1	O95456	288 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINA6	P08185	405 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	GRIA1	P42261	906 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	GLUD2	P49448	558 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SLC34A1	Q06495	639 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PDK1	Q15118	436 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	KPNA7	A9QM74	516 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559		H3BRJ5	948 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PIR	O00625	290 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	PDGFRB	P09619	1106 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	RILP	Q96NA2	401 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63

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