RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-240	ENST00000556339	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MARCH6	O60337	910 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ADCY5	O95622	1261 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	UQCRH	P07919	91 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SCG2	P13521	617 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	IL9	P15248	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	KCNA2	P16389	499 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TMOD1	P28289	359 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	GJB2	P29033	226 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CA8	P35219	290 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	IGFALS	P35858	605 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	IL12RB1	P42701	662 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NDUFV1	P49821	464 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NLRP5	P59047	1200 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CSRP2	Q16527	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TLE6	Q9H808	572 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF302	Q9NR11	478 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SI	P14410	1827 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CPLX1	O14810	134 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	TRIM24	O15164	1050 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	GRM6	O15303	877 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MAGEB2	O15479	319 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MTSS1	O43312	755 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SLC9A1	P19634	815 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NR4A1	P22736	598 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	GNA11	P29992	359 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FLT3	P36888	993 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NRIP1	P48552	1158 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SLC26A2	P50443	739 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	FAM193A	P78312	1265 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	KRT17	Q04695	432 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	HYAL1	Q12794	435 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	EPHA7	Q15375	998 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ME3	Q16798	604 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PRR16	Q569H4	304 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ATXN3-240	ENST00000556339	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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