RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	NCAM2	O15394	837 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CCL16	O15467	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TEX28	O15482	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HUS1	O60921	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RFPL2	O75678	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	LRIG2	O94898	1065 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	EPN2	O95208	641 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GLUD1	P00367	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PIGR	P01833	764 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	NR3C1	P04150	777 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	NTRK1	P04629	796 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ITGB3	P05106	788 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MYL1	P05976	194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KRT13	P13646	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CEACAM1	P13688	526 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	NME2	P22392	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PRCP	P42785	496 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	STX17	P56962	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	UBE2H	P62256	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RBP5	P82980	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DSG1	Q02413	1049 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SURF1	Q15526	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	NAB2	Q15742	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TAF12	Q16514	161 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ASB7	Q9H672	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	UBE4B	O95155	1302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TSC2	P49815	1807 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PDXK	O00764	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CETN3	O15182	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FANCG	O15287	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	INPPL1	O15357	1258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ADAM12	O43184	909 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TGM5	O43548	720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM13	O60858	407 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	LRG1	P02750	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ADRB2	P07550	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ODC1	P11926	461 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CYP3A5	P20815	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	NR2F2	P24468	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CXCL12	P48061	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CASP4	P49662	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TAF6	P49848	677 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CCR3	P51677	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CLCN4	P51793	760 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	LILRA4	P59901	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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