RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552548.5

PFDN5-217, Transcript of prefoldin subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene PFDN5, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5-217ENST00000552548 NPNTQ6UXI9 565 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 Q6ZNB5 142 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TMEM25Q86YD3 366 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ELMOD1Q8N336 334 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 NAT16Q8N8M0 369 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 COG1Q8WTW3 980 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 RNF139Q8WU17 664 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ASB16Q96NS5 453 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CNPY3Q9BT09 278 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TLR10Q9BXR5 811 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 KLC2Q9H0B6 622 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 HPS4Q9NQG7 708 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ABCC13Q9NSE7 274 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 STK39Q9UEW8 545 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CDH7Q9ULB5 785 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 INTUQ9ULD6 942 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 FZD10Q9ULW2 581 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 MAFFQ9ULX9 164 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ASB3Q9Y575 518 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.35□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 GFRA2O00451 464 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 POU2F2P09086 479 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 MYBL1P10243 752 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PYGMP11217 842 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 RALAP11233 206 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 GOT1P17174 413 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 GLDCP23378 1020 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CDC25CP30307 473 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 L1CAMP32004 1257 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ADRA1BP35368 520 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PEX5P50542 639 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SLC7A9P82251 487 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 KIF5AQ12840 1032 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 USP4Q13107 963 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 HTR4Q13639 388 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 FSCBQ5H9T9 825 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 GPR153Q6NV75 609 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 DAAM2Q86T65 1068 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 NPWQ8N729 165 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PQLC3Q8N755 202 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 HAUS1Q96CS2 278 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 NACA2Q9H009 215 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 EBF3Q9H4W6 596 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 COMMD8Q9NX08 183 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 STIM2Q9P246 746 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 HCN2Q9UL51 889 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 USP18Q9UMW8 372 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.34□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 MYO1FO00160 1098 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RNF103O00237 685 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CREB3O43889 395 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 GJB3O75712 270 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 LRIG2O94898 1065 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KRT1P04264 644 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 GLI1P08151 1106 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TACR2P21452 398 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms