RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	UCMA	Q8WVF2	138 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	BHMT	Q93088	406 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	MIS12	Q9H081	205 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	NUP205	Q92621	2012 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	THADA	Q6YHU6	1953 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137		E5RJQ4	531 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PIK3R2	O00459	728 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ACSL4	O60488	711 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ZNF217	O75362	1048 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	NCAM1	P13591	858 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	BCKDHB	P21953	392 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	DPP6	P42658	865 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TBX4	P57082	545 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SPACA7	Q96KW9	195 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	HLA-F	P30511	346 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	GBP1	P32455	592 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PI4KA	P42356	2102 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SNX16	P57768	344 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	WASH3P	C4AMC7	463 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TM4SF5	O14894	197 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CAVIN2	O95810	425 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	UCHL3	P15374	230 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	NDUFV2	P19404	249 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	SLC6A4	P31645	630 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	HOXD12	P35452	270 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	USP8	P40818	1118 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	IL12RB1	P42701	662 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	WAS	P42768	502 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	CREB5	Q02930	508 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	MTA1	Q13330	715 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-223	ENST00000551137	ZNF234	Q14588	700 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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