RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546080.5

SRP54-202, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 2,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-202ENST00000546080 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PRPSAP2O60256 369 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CRTAMO95727 393 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 DESP17661 470 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TGM2P21980 687 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MAGEA3P43357 314 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 RAP1GAPP47736 663 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 BCAR1P56945 870 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 AHI1Q8N157 1196 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 RTKNQ9BST9 563 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 APPL1Q9UKG1 709 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CNTNAP1P78357 1384 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 HMGCRP04035 888 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 GPD1P21695 349 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ARL2P36404 184 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 HDAC4P56524 1084 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CDO1Q16878 200 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MYLK3Q32MK0 819 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZNF534Q76KX8 674 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.63□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 A0A0J9YVX5 310 aa14.62□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZNF195O14628 629 aa14.62□□□□□ -0.07
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SRP54-202ENST00000546080 RALBP11234 206 aa14.62□□□□□ -0.07
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SRP54-202ENST00000546080 KLF10Q13118 480 aa14.62□□□□□ -0.07
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SRP54-202ENST00000546080 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.62□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 C4orf22Q6V702 233 aa14.62□□□□□ -0.07
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SRP54-202ENST00000546080 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.62□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.62□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.62□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TBC1D12O60347 775 aa14.61□□□□□ -0.07
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SRP54-202ENST00000546080 PRKG1Q13976 671 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ADGRE1Q14246 886 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.61□□□□□ -0.07
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SRP54-202ENST00000546080 CDK4P11802 303 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TPSB2P20231 275 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 NUDT2P50583 147 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 DGKZQ13574 1117 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PDK2Q15119 407 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SURF1Q15526 300 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TPSAB1Q15661 275 aa14.61□□□□□ -0.07
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