RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GATA3	P23771	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHA3	P29320	983 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PBX1	P40424	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CASP6	P55212	293 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TIRAP	P58753	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CXADR	P78310	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	FPGS	Q05932	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PDCL	Q13371	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TUBB3	Q13509	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CSHL1	Q14406	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ACOX1	Q15067	660 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ICE2	Q659A1	982 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CPT1B	Q92523	772 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67	2e-26	■□□□□ 8.9
SNHG1-222	ENST00000545308	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMD9	Q5K651	1589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PPH5	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308		M0QYT0	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308		M0QZQ0	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PPM1D	O15297	605 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	CFI	P05156	583 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PDHA1	P08559	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAF7	P61962	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM189B	P81408	668 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX19	Q92543	992 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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