RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC6Q86X45 466 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 RDH13Q8NBN7 331 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ENKURQ8TC29 256 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SHC3Q92529 594 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 GLMNQ92990 594 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CDCA5Q96FF9 252 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 HES6Q96HZ4 224 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 RNF38Q9H0F5 515 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 GGA3Q9NZ52 723 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CROTQ9UKG9 612 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 MYH11P35749 1972 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ASB14A6NK59 587 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PSMD11O00231 422 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TEX28O15482 410 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ASMTLO95671 621 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ITGA2BP08514 1039 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 EDNRBP24530 442 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CHN2P52757 468 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 LIN52Q52LA3 116 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 IER5Q5VY09 327 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 B3GALT6Q96L58 329 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 STK39Q9UEW8 545 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 M0QX08 132 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PEX1O43933 1283 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 MED26O95402 600 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SLURP2P0DP57 97 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 GALCP54803 685 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CLDN10P78369 228 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PRPSAP1Q14558 356 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 AGR3Q8TD06 166 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 APOL6Q9BWW8 343 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PORCNQ9H237 461 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 USP12O75317 370 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TNFRSF21O75509 655 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TJP3O95049 919 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ZBED1O96006 694 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 POU5F1BQ06416 359 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 METTL7BQ6UX53 244 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PACS1Q6VY07 963 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TMIEQ8NEW7 156 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF570Q96NI8 536 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 BBS2Q9BXC9 721 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 EFCAB14O75071 495 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB7AO95365 584 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 GLI1P08151 1106 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 LINGO3P0C6S8 592 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 OTULINQ96BN8 352 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PARVAQ9NVD7 372 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SUN2Q9UH99 717 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PAEPP09466 180 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 PMLP29590 882 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CDC42EP1Q00587 391 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.22□□□□□ -1.41
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